MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p1

Total Repeats: 3074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016585	CAG	2	6	1035905	1035910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_016585	GCA	2	6	1035925	1035930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_016585	GCC	2	6	1035936	1035941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_016585	CGA	2	6	1035964	1035969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_016585	TCG	2	6	1035976	1035981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016585	CCG	2	6	1036015	1036020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_016585	GGCG	2	8	1036058	1036065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_016585	CGC	2	6	1036174	1036179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_016585	CGG	2	6	1036224	1036229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_016585	GAG	2	6	1036252	1036257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016585	GGT	2	6	1036263	1036268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016585	GATG	2	8	1036488	1036495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016585	CGG	2	6	1036517	1036522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_016585	GCG	2	6	1036597	1036602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016585	CG	3	6	1036601	1036606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_016585	TACG	2	8	1036654	1036661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_016585	CAG	2	6	1036722	1036727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_016585	CGC	2	6	1036735	1036740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_016585	GTG	2	6	1036754	1036759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016585	CAC	2	6	1036762	1036767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_016585	TCA	2	6	1036803	1036808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_016585	CGC	2	6	1036847	1036852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_016585	GCC	2	6	1036857	1036862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_016585	CCG	2	6	1036906	1036911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_016585	CCTC	2	8	1036917	1036924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3026	NC_016585	GGC	2	6	1036978	1036983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016585	GCA	2	6	1037013	1037018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_016585	AAC	2	6	1037457	1037462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_016585	AGG	2	6	1037569	1037574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016585	TCG	2	6	1037590	1037595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_016585	AGG	2	6	1037599	1037604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016585	AGA	2	6	1037629	1037634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016585	TCG	2	6	1037687	1037692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016585	GGT	2	6	1037739	1037744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016585	GAA	2	6	1037762	1037767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016585	GCT	2	6	1037776	1037781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016585	CAA	2	6	1037792	1037797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016585	CCCCT	2	10	1038121	1038130	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3039	NC_016585	GAG	2	6	1038198	1038203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016585	TCC	2	6	1038226	1038231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_016585	TGC	2	6	1038286	1038291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_016585	GCG	2	6	1038292	1038297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_016585	GGC	2	6	1038302	1038307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016585	CGC	2	6	1038320	1038325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_016585	CGC	2	6	1038339	1038344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_016585	GAA	2	6	1038351	1038356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016585	GTTG	2	8	1038411	1038418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016585	GCT	2	6	1038474	1038479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016585	TGTC	2	8	1038492	1038499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_016585	GATG	2	8	1038509	1038516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016585	GGC	2	6	1038575	1038580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016585	GGGAT	2	10	1038645	1038654	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016585	ACC	2	6	1038678	1038683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_016585	GTGAG	2	10	1038741	1038750	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016585	TGC	3	9	1038800	1038808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_016585	GTCC	2	8	1038879	1038886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_016585	CCT	2	6	1038892	1038897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_016585	ACG	2	6	1039121	1039126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_016585	TGA	2	6	1039201	1039206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016585	TCA	2	6	1039255	1039260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016585	CGA	2	6	1039396	1039401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_016585	CG	3	6	1039431	1039436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_016585	CCCGGA	2	12	1039493	1039504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016585	GGT	2	6	1039539	1039544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016585	CAC	2	6	1039621	1039626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_016585	GTA	2	6	1039636	1039641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016585	GCC	2	6	1039809	1039814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_016585	TTCAA	2	10	1039827	1039836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_016585	CCTCT	2	10	1039845	1039854	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3070	NC_016585	TG	3	6	1039899	1039904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016585	C	6	6	1039957	1039962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3072	NC_016585	CTT	2	6	1039991	1039996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_016585	TC	3	6	1040039	1040044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_016585	GGC	2	6	1040357	1040362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.